アラタとトリニティセブンたちは、この世界を守れるのか？彼らの最後の戦いが今、始まる！
すべては“愛”に収束する――――封印されていた記憶がいま紐解かれる。
人類の未来のため、自らの過去のため、少年(千早群像)は。新たな旅路へ向かう。愛機・潜水艦イ401(イオナ)は過去に囚われたまま――
コンゴウとの壮絶な決戦を経て、サンディエゴに「人類の切り札」を届けた群像たちの次なる目的は？そして新たに立ちはだかる影は――――